《变形金刚》第一部电影的故事发生在遥远的未来，地球与宇宙中的其他星球一样，被一种名为“能量晶体”的神秘物质所环绕。能量晶体是一种强大的能源，能够赋予生命无限的力量。
故事的主人公是汽车人和霸天虎，两派势力为了争夺能量晶体而展开了一场旷日持久的战争。汽车人是一群正义的机器人，以保护地球和人类为己任；而霸天虎则是一群邪恶的机器人，企图征服地球，掠夺能量晶体。
影片开始，汽车人和霸天虎在宇宙中展开了一场激烈的战斗。汽车人领袖擎天柱（Optimus Prime）在战斗中不幸受伤，被流放到地球。在地球上，他遇到了一群热爱汽车的孩子们，他们分别是萨姆（Sam Witwicky）、米克（Mick Rockwell）、凯特（Kate Nautrea）和杰克（Jack Lennox）。
萨姆是一位高中生，他无意间发现了一辆神秘的汽车——赛博坦（Cybertron）星球上的汽车人成员“大黄蜂”（Bumblebee）。大黄蜂为了保护萨姆，将他带到了汽车人的秘密基地。在那里，萨姆得知了汽车人和霸天虎之间的战争，以及能量晶体的秘密。
为了拯救地球，汽车人决定寻找能量晶体的源泉。在萨姆的帮助下，汽车人找到了能量晶体的所在地——美国加州的旧金山。**，霸天虎也发现了这个秘密，并派出了他们的领袖——威震天（Megatron）率领一支强大的部队前来争夺。
在旧金山，汽车人和霸天虎展开了一场激战。汽车人虽然英勇善战，但霸天虎的数量众多，形势十分危急。关键时刻，萨姆和他的朋友们决定加入战斗，他们驾驶着大黄蜂和其他汽车人，与霸天虎展开了殊死搏斗。
经过一番激战，汽车人终于击败了霸天虎，成功保护了能量晶体。**，威震天并没有放弃，他发誓要重返地球，继续征服地球。在战斗的***擎天柱为了保护萨姆，牺牲了自己，将威震天封印在地球的地下。
《变形金刚》第一部电影以汽车人的胜利告终，但故事并未结束。在电影结尾，萨姆和他的朋友们发现了一个神秘的信号，预示着霸天虎即将卷土重来。这也为后续的《变形金刚》系列电影埋下了伏笔。
